FUNDAEXPRESIÓN cuenta con recursos físicos constituidos principalmente por instalaciones de oficina, computadores, equipos de comunicación e investigación, un centro de documentación especializada. Además forma parte de una red de comunidades campesinas y centros de educación, dando acceso a material educativo, equipos de capacitación, experiencias demostrativas y bancos de semillas criollas en diferentes regiones de Colombia.